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Post by jone447 on Aug 2, 2023 1:03:15 GMT -5
理解很差。此外,组织代谢过程(即氨基酸、葡萄糖、脂质和胆固醇代谢)期间真实生理状态中RBP介导的转录后调节尚未得到解决。主要原因是 CLIP 技术依赖于通过紫外光进行有效的 RBP-RNA 交联,由于短长度光的穿透深度低,这成为一个限制因素,限制了这种方法用于 2D 细胞系培养。 为了解决这一限制,我们开发了 viP-CLIP,一种 体内 PAR-CLIP 方案,通过使用光活化核糖核苷 4SU 来克 亚洲手机号码列表服短长度紫外光的限制。我们首先在小鼠中对 4SU 进行了全面的药代动力学研究,得出了平均 mRNA 两个半衰期的推荐 4SU 剂量方案,这不会导致毒性,并导致 4SU 在组织 RNA 中的掺入率足够。4SU 的掺入可以增加交联 UV 波长并提高完整哺乳动物器官中 的交联效率,这通过多个器官和 RNA 类别的测序读数中 T 到 C 转换的增加来证明。 我们注意到,根据器官的不同,交联效率不仅仅取决于其 4SU 掺入率,还取决于感兴趣的 RBP 的丰度及其活性。TIAL1 在睾丸中高表达,据报道在生殖细胞发育中发挥不可或缺的作用24,并且与其他器官(例如心脏)相比,根据 4SU 掺入率,。我们假
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